《獵人劇場版－最終任務》是【獵人HUNTER×HUNTER】的第二部動畫電影作品，獵人協會被染血的過去和被封印的「黑暗」將解放。過去在獵人協會裡存在著擁有強大力量的獵人們，但他們被「光明」與「黑暗」的力量分裂，走向了各自不同的道路。而現在為了抹殺所有的獵人，「黑暗」開始行動了……小傑與奇犽、酷拉皮卡、雷歐力，造訪在天空鬥技場舉辦的戰鬥祭典「奧林匹亞武鬥大會」。比賽會場上聚集許多獵人和權貴顯要，他們突遭某個武裝集團襲擊，而一名男人連續撂倒保護顯要的特勤們，他的真正身分，竟是十多年前應已被消滅的「黑影」過去與尼特羅共同維持獵人協會運作的黑影隊長傑德，為了幫喪命於尼特羅手下的同伴雪恨，報復當時捨棄黑影的獵人協會，他發出了「殲滅所有獵人！」的宣戰聲明。但傑德以「怨」能力牽制住尼特羅，天空競技場則在「黑影」的控制下，徹底遭到封鎖。小傑是否能戰勝「怨」能力者傑德，救出尼特羅呢？獵人協會的闇黑面即將浮出檯面。